太阳2官网:研究思路|微生物组+代谢组多组学应
今天为大家分享几篇微生物组+代谢组多组学应用在肠道样本中的文献案例。
案例1
题目:饮食和运动在肠道微生物-宿主共代谢中的作用研究
期刊:mSystems
IF:6.633
发表时间:2020.12
DOI号:10.1128/mSystems.00677-20
研究方法:16S+宏基因组+靶标代谢组
本文为了研究饮食和体育锻炼对新陈代谢和肠道微生物群的单独和联合影响,收集运动员和不经常运动的人的粪便和尿液样本太阳2官网,比较两组样本之间代谢表型和肠道微生物的差异。结果发现,两组样本间表现出独特的代谢表型和微生物多样性差异。微生物多样性与高度坚持健康饮食习惯和身体锻炼相呼应,并与一系列不同的微生物衍生代谢物相关。
案例2
题目:代谢和代谢紊乱与微生物群:与肥胖、脂质代谢和代谢健康相关的肠道微生物群:病理生理学和治疗策略
期刊:Gastroenterology
IF:17.373
发表时间:2020.11.27
DOI号:10.1053/j.gastro.2020.10.057
研究方法:16S+宏基因组+代谢组
本文通过对肠道微生物群与代谢性疾病、脂质代谢的关系等方面进行综述,对于促进理解代谢组学和微生物组学的关联性研究、了解当下的研究背景和热点有很高的参考价值。目前在流行病学研究和对无菌小鼠粪便移植影响的研究中发现肠道微生物群的变化与肥胖和2型糖尿病有关,本综述结合小鼠模型的相关研究,讨论将其用于人体健康代谢改善的方法。
案例3
题目:妊娠糖尿病中肠道细菌和代谢特征的改变及其相互作用
期刊:Gut Microbes
IF:7.740
发表时间:2020.11
DOI号:10.1080/19490976.2020.1840765
研究方法:16S+宏基因组+代谢组
经证实,宏基因组学与代谢组学联合分析是揭示肠道微生物组成和各种疾病功能的有效方法。本研究通过分析肠道微生物和代谢产物之间的相关性,探究了妊娠糖尿病中肠道细菌和代谢特征的改变及其相互作用。研究发现妊娠糖尿病患者的微生物和代谢特征与健康孕妇显著不同,其中Lachnospiraceae和Enterobacteriaceae的OTUs与参与宿主糖类代谢的几种代谢物形成强烈的共现关系,表明微生物成分和代谢功能的改变可能与妊娠糖尿病的发病机制和病理生理有关。
点 评
16S rRNA测序虽然可以方便地研究微生物群的组成,但由于目前对于菌群基因库认知的不完全性,限制了对有关代谢物影响的理解。宏基因组测序为现有的基因提供了更深入的了解,但这些基因中的大多数功能仍然未知。为了进一步了解相关微生物菌群的功能潜力,可以进行微生物组+代谢组多组学联合分析,在了解微生物多样性的同时,探寻微生物对机体生化和功能的影响。
上述几篇研究结合微生物组和代谢组多组学联合方法,构建了微生物与代谢组之间的网络关系,克服了单一组学研究的局限性,多角度理解微生物与代谢关系之间的联系,填补了微生物与代谢关系研究数据上的空白。
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